弗朗西斯科·德·阿魯達（Francisco de Arruda）在從北非返回時，被任命為貝倫塔要塞的總工程師。1514年，貝倫塔的建設開始了。當時是在王國的皇家工程大臣迪奧戈·德·波伊塔卡（Diogo de Boitaca）的指導下開始的。貝倫塔于1520年完工。
隨著時間的流逝，該塔經歷了無數次的改造。其中19世紀，改造達到了頂峰：塔本身保留了中世紀的風格 ，只不過要窄得多，且有四個拱頂的房間；而堡壘經改建，更加現代化，包括在原來放置大炮的地方設置了匹配物。
之后，隨著新堡壘的建設，貝倫塔已經失去了它當初作為特茹河防護地的作用。后來，它被用作海關、電報站甚至是燈塔，還將其貯藏室被改造成的地牢，被用作為監獄。據說，罪越重的犯人，就被關在越底層。當潮漲的時候，底層的犯人就會被淹死。
今天站在高高的貝倫塔上，似乎看到了諸多航海家前仆后繼的大膽探險——哥倫布發現了美洲新大陸，達·伽馬打開歐洲與印度的通商之門，麥哲倫則以實踐證實了“地球是圓的”真理。面對波濤洶涌的大海，航海的先驅者以生命和頑強的意志來探索人類之秘。
貝倫塔就像聳立在美國紐約入港處的自由女神像一樣，成為葡萄牙的象征！
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